Akademia MKS Znicz Pruszków powstała z przeistoczenia się grup młodzieżowych MKS Znicz Pruszków w maju 2011 roku. Jej celem jest szkolenie młodych graczy na najwyższym poziomie oraz wychowywanie ich na przyszłych zawodników I i II drużyny MKS Znicz Pruszków, a co za tym idzie kreowanie ich na piłkarzy pokroju Radosława Majewskiego, będącego wychowankiem pruszkowskiego Klubu. Akademia Piłkarska MKS
Znicz Pruszków posiada dobrze wykwalifikowany sztab szkoleniowy, złożony z trenerów z wieloletnim doświadczeniem na polu pracy z młodzieżą oraz posiadającym doświadczenie zawodowej gry w piłkęnożną w Polsce oraz w Niemczech. Managerem Akademii jest Radosław Mozyrko, który zajmuje się profesjonalnym trenowaniem piłki nożnej od 2007 roku i który doświadczenie trenerskie zdobywał w czterech krajach: Stanach Zjednoczonych, Anglii, Irlandii i w Polsce. Strategia i system szkolenia Akademii MKS Znicz Pruszków oparty jest na modelach zagranicznych, które Radosław Mozyrko poznał w czasie licznych staży trenerskich, m.in. Akademia ponadto czerpie wzorce szkoleniowe z Akademii Piłkarskiej Ajax Amsterdam oraz Valencia C.F. Aby dostać się do Akademii MKS Znicz Pruszków, należy przyjść na organizowane przez nią nabory, które odbywają się dwa razy w roku: w kwietniu oraz we wrześniu lub skontaktować się z trenerem drużyny naborowej.